1、功能性便秘是儿童最为常见的疾病。为避免排便所致痛苦而惧怕排便、以致大便滞留所致。许多因素可导致排便不适，如屡郭瓜开排便训练、日常生活或饮食改变、压力性事件、疾病、无厕所排便或因繁忙而延迟排便等。大便滞留导致大便淤积于结肠、水分被吸收、大便则变粗变硬。 粗硬大便排出使肛门扩张疼痛、使儿童恐惧而不愿排便。在数天无大便排出后，儿童可出现易怒、腹胀、肠痉挛及进食减少。
2、健康教育 ： 治疗功能性便秘的第一步就是教育和安抚父母对便秘的误解和恐惧， 告知他们功能性便秘是婴儿最常见的症状之一 ，较少引起不良后果 。鼓励家长学习一些儿童便秘的相关知识，消除紧张心理，指导日常生活 。
3、饮食调整 ： 6月龄以内小婴儿尽量母乳喂养， 增加液体摄入； 6月龄以上婴儿可适当增加富含纤维膳食的摄入量，能减少便秘发生。
4、定时排便及排便练习（27个月以后）、腹部顺时针按摩、适当地运动。药物治疗 ： 补充微生态制剂 ，如乳酸杆菌 、双歧杆菌等已被广泛应用。
5、益生菌是一种对人体有益的活细菌 ， 服用足够数量益生菌，可以有效增加有益菌数量，主要以乳杆菌类和双歧杆菌类为主要代表。 益生菌能给予人体除基本营养以外的健康益处。 研究发现，酸奶中一般以双歧杆菌为主，不仅能促进肠道健康 。
6、便秘与肠道菌群有很大关系 ， 通过额外补充肠道内的益生菌还能刺激肠蠕动。增加粪便湿润度，缩短排泄物在结肠内茸， 可抑制肠道内有害菌的生长 ， 维持肠道微生态平衡，停留的时间，防止便秘。同时还具有提高机体免疫力 、 提高粪便中的水分含量 。