1、冷库保存将冬瓜放置于冷库的环境中，采用低温保存的方法，可储存4~6个月的时间。
2、田间储存法可将尚未成熟的冬瓜，在其底下垫上麦秆或者甘草，之后上边再铺上麦秆或者甘草，能够有效避免阳光直射和防止过潮腐烂。
3、窖藏法将冬瓜放置于阴凉、通风、干燥的地窖中进行储存，需要注意的是保持窖内温度和湿度，不可起伏太大，否则会影响储存效果。冬瓜属于喜温耐热，锺蓝姨矿冷敏性的瓜类，最好的储存方法是窖藏法，在温度10~15℃，相对湿度维持在70~75％，并且通风良好的情况下，可保存数月不会腐烂。如果是已经切开的冬瓜，则要用保鲜膜将其包裹住，之后放置冰箱的保鲜层即可，可存放2~3天。