1、恶变趋势：肛瘘可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，殃及周围脏器，高位肛瘘最严重的是有恶变倾向。
2、影响身体：通常会出现身体虚弱，精神颓废，身体免疫力下降等症状，会出现贫血，致使患者虚弱消瘦。
3、影响生理功能：由于多次反复发作，脓液可穿破管壁顺着括约肌间隙进行蔓延，从而形成各种多发病、复杂性肛瘘，不但给治疗带来了困难，还会给患者的肛门带来影响，甚至影响其生理功能。
4、影响工作生活：这种情况的出现会污染内裤，若是患者的户外活动过分剧烈的话，将会致使脓汁外溢，皮肤摩擦、痛痒，局部经常受到刺激，影响患者的生活和工作。