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纤维类组织RNA提取方法及步骤

时间:2025-01-05 02:49:45

1、第一次使用前请先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇!操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。充分破碎匀浆(非常重要,否则严重降低产量)a. 电动破碎匀浆(首选强烈推荐,产量最高结果最稳定):取约10-20mg(<30mg)新鲜组织,加入300μl裂解液RLT后用电动刀片匀浆机(Rotor-Stator如TissueRupter)或者电动玻珠研磨机(Bead Mill如TissueLyser)按照机器使用说明彻底破碎匀浆组织细胞。b. 液氮研磨+匀浆:在液氮中研磨组织成细粉后,取适量组织细粉10-20mg(<30mg)转入装有300μl裂解液RLT的1.5ml离心管中, 用手剧烈振荡20秒,充分裂解。用带钝针头的一次性 1 ml(配0.9mm针头) 注射器抽打裂解物 10 次或直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒) ,可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。讲匀浆转入新离心管。c. 研钵研磨匀浆: 取适量组织细粉10-20mg(<30mg)放入小研钵后,迅速加入300μl裂解液RLT后直接室温充分研磨匀浆。将匀浆转入新离心管。注意:如果匀浆沾在研钵内损失比较大,可以按照比例适当提高起始组织用量和裂解液RLT用量。此外,也可以先用液氮研磨组织成细粉,然后液氮刚刚蒸发完的时候加入裂解液RLT充分研磨匀浆,可以提高研磨效果。

2、吸取590μl RNase-free H2O至匀浆中。加入10μl蛋白酶K,移液器吹打混匀。

3、55℃下水浴10分钟。

4、室温下以13,000rpm离心5分钟。这样将会形成小量的组织碎片沉淀,而且在上清的顶部可能看见少量的漂浮物。

5、转移上清至一个新的1.5ml离心管中。注意:转移时不要带入沉淀物,而且移液枪头必须放在上清漂浮物之下。漂浮物通常可能会黏附在枪头的外壁,注意不能将其带入离心管中。

6、较精确估计裂解物(上清)体积,加入0.5体积的无水乙醇(一般为450μl),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。

7、立刻将混合物(每次小于700μl,可以分两次加入)加入同一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心60秒,弃掉废液。

8、加700μl 去蛋白液RW1,室温放置30秒,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。如果DNA残留明显,可在加入RW1后室温放置5分钟再离心。

9、加入500μl漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RW,,重复一遍。

10、将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

11、取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热可提高产量), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。

12、可选:使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。洗脱两遍的RNA洗脱液RNA浓度可以适当提高一些。如果预期RNA产量>30μg,可加30-50μl RNase free water重复步骤11,合并两次洗脱液,可以提高产量15–30%,但浓度会有所降低。

13、关于DNA 的微量残留:一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留,EASYspin系列RNA提取产品,由于采取了独特的缓冲体系和选择了特殊吸附能力的吸附膜,在大多数RT-PCR 扩增过程中极其微量的DNA残留(一般电泳EB染色紫外灯下观察不可见)影响不是很大, 如果要进行严格的mRNA表达量分析如荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:1) 选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与扩增反应。2) 选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。3) 将RNA提取物用RNase-free的DNase I 处理。。在步骤去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上进行DNase I处理。

14、RNA 纯度及浓度检测:完整性: RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳 (电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150v,15 分钟)检测完整性。由于细胞中70%-80%的RNA 为rRNA,电泳后UV 下应能看到非常明显的rRNA 条带。动物rRNA 大小分别约为5 kb 和2kb,分别相当于28S 和18S rRNA。动物RNA 样品中最大rRNA 亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0 倍,否则表示RNA 样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。纯度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA,OD260/OD280 读数(10mMTris, pH7.5)在1.8-2.1 之间。OD260/OD280 读数受测定所用溶液的pH 值影响。同一个RNA 样品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中测出的OD260/OD280 读数1.8-2.1 之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9 之间,但这并不表示RNA 不纯。浓度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水稀释n 倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260, OD280 测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/μl)= (OD260)×(稀释倍数n)×40。

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