天然肠衣是由羊、牛、猪的肠以及膀胱除去粘膜后腌制或干制而做的。
肠衣可以分为两种，一种是天然肠衣，另一种是人造肠衣。灌肠使用的基本上都是天然肠衣，就是我们常见的家畜的大小肠如猪大肠、猪小肠、羊小肠、牛大肠等制作而成。天然肠衣比较坚韧，它的透气性和弹性都很好，保水性也很强，用它灌肠可以安全放心食用。
人造肠衣，分为透气性肠衣和非透气性肠衣。人造肠衣的透气性、伸缩性和弹性都比较差，没有天然肠衣的好，透气性肠衣又可分为可以食用和不可以食用的。人造肠衣按照材料可分为塑料肠衣、纤维素肠衣、胶原肠衣三种，但其中只有胶原肠衣是可以食用的。