1、肠道内有寄生虫，蛔虫。它会在晚上孩子睡着在肚子里活动，分泌的毒素使人肚子疼、恶心、呕吐，严重者患肠梗阻外，如果毒素刺激神经，还会使人夜间磨牙，也是靠吸收人体内的营养而生存的。
2、胃消化不良，例如睡前吃得太多或难消化的东西，刺激消化道使脑细胞兴奋起来，产生反射作用，而磨牙。或有胃病，使胃不停的消化食物，导致睡觉后磨牙。
3、或是白天或入睡前玩耍过于疲劳或精神过于激动，或受到什么惊吓产生不安，入睡后大脑皮层还在兴奋，不自觉咀嚼，产生了磨牙。
4、由于夜间磨牙一般是在熟睡后因神经反射的作用而发生，和白天吃饭时的咀嚼是不一样的，只是在上下磨牙，这样使牙齿非常受伤，磨损严重。使牙齿外层牙釉质磨耗，更容易引起牙髓炎。长期下去会影响整体美观，严重的会造成牙周组织和颞颌关节损伤。
5、简单的就是换牙期牙齿发育不良引起牙齿的咬合障碍，慢性牙周炎。或是神经系统疾病，精神运动性癫痫，癔病。不经常的或只是做梦吃东西。
6、缺乏维生素，挑食引起营养不均衡，使磷，钙等维生素和微量元素缺乏，孩子夜间常常会出现多汗、夜惊、烦躁不安或引起面部咀嚼肌的不自主收缩，致使夜间磨牙。
