样品殿秩痊肭层在浓缩胶中能得到浓缩是因为：浓缩胶的作用是有堆积作用，凝胶浓度较小，孔径较大，把较稀的样品加在浓缩胶上，经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。
当样品液和浓缩胶选pH6.8的TRIS/HCL缓冲液，电极液选TRIS/甘氨酸。电泳开始后，HCL解离成氯离子，甘氨酸解离出少量的甘氨酸根离子。蛋白质带负电荷，因此一起向正极移动，其中氯离子最快，甘氨酸根离子最慢，蛋白居中。
浓缩叫的配置方式
一般同工酶可选择7.5%～10%的胶(过氧化物酶和酯酶7.5%较合适，超氧化物歧化酶用10%，可溶性蛋白可根据需要配制)。将配制好的凝胶液置真空干燥器中，抽气10Min，再加入TEMED15μl；混匀后用一细玻棒引流，沿无凹槽的玻板缓缓注入胶室中，注胶过程要防止气泡产生。
胶液加到离凹槽3CM处为止，立即用注射器轻轻在胶溶液上面铺1CM高的水层，但不要扰乱丙烯酰胺胶面。待分离胶和水层之间出现清晰的界面时，表示聚合已完成。
用注射器小心吸出上层覆盖水，按表5－1配制好浓缩胶，抽气后加入5μlTEMED，混合后加到分离胶上层，插入预先选择好的样品梳，注意不要带入气泡。