1、申请公积金贷款时，为了以后方便还贷，申请人需要同公积金管理中心、受委托银行三方签订公积金代扣还款协议。协议生效后，受委托银行在还款的第二月开始的每月10号左右从指定的公积金账户中扣除贷款人当月该还款的金额到该银行的还款账户里，用来抵消公积金贷款。
2、代扣公积金还贷有两种方式：一种是全额委托扣款，即每月缴存的公积金大于每月还贷额，且公积金账户上有六个月还贷金额。另一种是部分委托扣款，即每月缴存公积金小于每月还贷额，不足部分由自己另外拿钱还，这种情况个人公积金账户上需留三个月缴存额.
3、办理公积金代扣要携带以下的原件，最好带上复印件到相关的银行去办理公积金账号1、身份证2、个人银行卡或者储蓄卡（办理按月扣需要）3、就业登记证