1、骨骼异常：神经纤维瘤病患者非常容易出现骨骼异常，最常见的异常包括骨质减少（或者叫骨质疏松）、脊柱侧弯、蝶骨翼发育不良、先天性胫骨发育不良、胫骨假关节等。
2、心血管异常：接近四分之一的神经纤维瘤病的患者会伴有心血管异常，包括先天性心脏病、肺动脉狭窄、大脑动脉狭窄、肾动脉狭窄、主动脉弓缩窄。如果患者出现不能解释的高血压的情况，或者相应器官异常，也需要进行这些靶器官动脉的影像学检查。
3、认知障碍：神经纤维瘤病可以合并认知障碍，也可以出现智力受损，尽管出现比例不高，但是可以严重影响患者智力。最常见的表现是学习困难、注意力不能集中、多动症。
4、恶性神经鞘瘤：这是神经纤维瘤病里面最常见的一种恶性肿瘤，可以发生在丛状神经纤维瘤基础上，或者在新的地方出现。本病在1型神经纤维瘤病患者中的终身发病率是8-13%左右。
5、各种恶性肿瘤：神经纤维瘤病患者出现胃肠道间质瘤、乳腺癌（高于正常人5倍）、白血病或者淋巴瘤（高于正常人7倍）、嗜铬细胞瘤（0.1-5.7%）及平滑肌肉瘤（高于正常人20倍）的概率明显增高。