1、分发模式不同
苹果企业签名：使用的是苹果企业开发者账号生成的证书，给app进行签名鉴权，从而达到无需上架App Store应用商店就可以轻松安装到苹果手机上面。用签好企业签名的APP，去做分发即可让用户下载安装。
苹果超级签名：使用个人开发者账号，通过生成的分发链接，让用户在安装时创建描述文件，利用描述文件获取到用户设备ID，根据ID在服务端把安装包进行重打包，在对开发证书进行修改新增下载，再进行分发。
2、签名的稳定性不同
苹果企业签名：目前市场上将企业签名分为三种类型，分别是共享版企业签名，稳定版企业签名和超稳版企业签名，共享版企业签名稳定性很差，随时都有掉签的风险，另外两种稳定性会比较好，稳定性和价格是成正比的。
苹果超级签名：是由苹果个人开发者进行打包的，稳定性相比企业签名还是很高的，掉签的概率是比较低的。