两种方法：
1、由公安机关提请人民检察院批准逮捕然后再审查起诉。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第一百一十五棰很于秋条规定，对有证据证明有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚的犯罪嫌疑人，采取取保候审、监视居住等方法，尚不足以防止发生社会危险性，而有逮捕必要的，应即提请批准逮捕。在司法实践中，由于有考核指标的压力，公安机关的部分干警认为在查实有犯罪事实存在，并且有初步证据证实该犯罪事实是被认定的犯罪嫌疑人所为时，就可以向检察机关提请批准逮捕。
所以，对发现罪犯在服刑期间有漏罪或新罪的情形下，有的公安机关将此类案件提请人民检察院批准逮捕。但是，根据刑事诉讼法关于逮捕构成三要件的规定，此类罪犯已经被羁押在看管场所之内，已无社会危害性可言，即使有证据证明有犯罪事实且可能判处徒刑以上刑罚，仍只能作出不批准逮捕的决定。
2、侦查完毕后移送检察机关直接审查起诉。刑事诉讼法第二百二十五条规定，对罪犯在监狱内犯罪的侦查由监狱进行侦查，监狱办理刑事案件，适用本法的有关规定。即罪犯在服刑期间又犯罪的，应当由监狱进行侦查，侦查终结后，由监狱写出起诉意见书，连同案件材料、证据一并移送人民检察院处理。
如果罪犯在监狱之外服刑的，应由公安机关进行侦查，并在侦查终结后，写出起诉意见书，连同案件材料、证据一并移送人民检察院处理。对于漏罪和新罪，应当按照刑事诉讼法关于管辖的规定和刑法关于数罪并罚的规定追究刑事责任。
扩展资料
原判刑罚改变数罪并罚
《刑法》第七十条和第七十一条的规定，是针对被告人在判决宣告以后刑罚执行完毕以前，原判主刑刑种及刑期没有变更的情况下作出的。对于事实上依照刑法规定在刑罚执行中被依法由死缓裁定为无期徒刑和被依法减刑的罪犯，又发现有漏罪或重新犯罪后应如何实行数罪并罚，刑法仅作出部分解释，没有详尽，最高人民法院也没有司法解释。
(1)刑种变更后又发现漏罪的情况。包括死缓裁定为无期徒刑后又发现漏罪和无期徒刑减为有期徒刑后又发现漏罪两种情况。应把裁定后的刑罚和新发现的罪所作出的判决，依照刑法第六十九条的规定，决定执行的刑罚，由无期徒刑减为有期徒刑后已经执行的刑期，应当计算在新判决决定的刑期以内。
(2)刑种变更后又重新犯罪的情况。仅指由无期徒刑减为有期徒刑后又重新犯罪的情况(不含死缓重新犯罪)。应当先减去原裁定减为有期徒刑后执行的刑期，然后将剩余刑期与新判刑罚按照刑法第六十九条的规定，决定执行的刑罚。
(3)前罪被判处有期徒刑、拘役、管制，依法减刑后又发现漏罪的情况。应先将原判刑罚与后判刑罚按照刑法第六十九条的规定，决定执行的刑罚，然后减去已执行刑期和减刑刑期。
(4)前罪被判处有期徒刑、拘役、管制，依法减刑后又重新犯罪的情况。
第十八条 几个公安机关都有权管辖的刑事案件，由最初受理的公安机关管辖。必要时，可以由主要犯罪地的公安机关管辖。
具有下列情形之一的，公安机关可以在职责范围内并案侦查：
（一）一人犯数罪的；
（二）共同犯罪的；
（三）共同犯罪的犯罪嫌疑人还实施其他犯罪的；
（四）多个犯罪嫌疑人实施的犯罪存在关联，并案处理有利于查明犯罪事实的。
第十九条 对管辖不明确或者有争议的刑事案件，可以由有关公安机关协商。协商不成的，由共同的上级公安机关指定管辖。
对情况特殊的刑事案件，可以由共同的上级公安机关指定管辖。
第二十条 上级公安机关指定管辖的，应当将指定管辖决定书分别送达被指定管辖的公安机关和其他有关的公安机关。
原受理案件的公安机关，在收到上级公安机关指定其他公安机关管辖的决定书后，不再行使管辖权，同时应当将案卷材料移送被指定管辖的公安机关。
参考资料来源：百度百科-公安机关办理刑事案件程序规定