1、鉴别牡丹种类，普通是经过花的外形、颜色、香型来辨别，其次是经过叶、芽、干、根、果以及株形和分枝方式来辨认。
2、从花冠鉴别：花是审定牡丹种类最主要的根据，其特征主要集中于花冠。
3、普通可分为：单瓣型，花瓣1至3轮，宽大，雄雌蕊正常，如‘黄花魁’;荷花型，花瓣4至5轮，宽大分歧，开放时形似荷花，如‘似荷莲’;菊花型，花瓣多轮，自外向内层层排列逐步变小，如‘彩云’
4、蔷薇型，花瓣自然增加，自外向内明显变小，少局部瓣化，如‘大棕紫’;托桂型，外瓣明显，宽大且平展，雄蕊瓣化，自外向内变细而稍隆起，呈半球型，如‘大胡红’;
5、金环型，外瓣突出且宽大，中瓣狭长竖直，呈金环型，如‘姚黄’;皇冠型，外瓣突出，中瓣越离花心越宽大，形如皇冠，如‘赵粉’;绣球型，雄蕊完整瓣化，排列紧凑，呈球型，如‘赤龙换彩’;楼子台阁型，由2朵或2朵以上楼子类单花上下堆叠而成，如‘玉楼点翠’。
6、从花色上分：牡丹可分红、黄、绿、黑、白、紫、蓝、粉、复色九大色系，在每个色系里又分很多种类，这是最容易分别的。如‘胡红’一看就晓得是红色，‘昆山夜光’是白色，‘黑花魁’是黑色，‘花二乔’和‘岛锦’有两种颜色，故为复色。
