1、打开MS新建一个3D atomistic,重命名:
2、导入结构(这里小编是从文献中的实验数据得来的一个结构)
3、小编要计算面一个基团的稳定性。需要选出一个基团,按照小编以前说的方法去掉周期性后,再删除原子,剩下一个要计算的基团如下图
4、选中所有原子,然后复制(Ctrl+C)
5、新建一个P1结构的晶格
6、然后(Ctrl+V)粘贴原来选出来的结构
7、但是会发现出现两个结构,通过如下图按钮,结合调整,至一个结构在晶格中间
8、build--crystals-rebuild(小编之前有讲过)
9、再进行调整,调到中间
10、ok,开始进行计算。这里目的就是建立一个大的晶格,然后消除边界周期性影响