1、 对校企合作办学理念认识不够从企业方面，多数企业由于对校企合作缺乏战略思考和实践经验，在校企合作中处于消极与被动状态，使校企合作最终成为企业对学校的公益支持或功利性的投资，使校企合作陷于有无合作的状态。从学校方面，对校企合作的认识也不到位，存在着恪守固定模式关门办学、闭门造车等观念上的问题，合作不够积极主动，要么强调客观，原地踏步; 要么被动跟风，搞花架子，反映在行动上，必然会是坐等企业上门，缺乏校企合作的积极性和主动性。
2、 校企合作不够深入对校企合作缺乏整体推进， 没有从系统的观点通盘考虑，统筹运作，使企业运行与办学诸要素之间有机结合、相互作用，构成一个具有特定功能的整体，最优化地实现办学目标，以期达到预期的效果。不少学校开展校企合作仍停留在聘请企业专家上课，举办企业家报告会，送学生去企业参观实习等浅层次合作，校企双方还是两张皮，离互动介入，相互交融，深度合作，形成学校与企业的利益共同体还有较大差距。
3、 校扳垣傧醒企合作不够深入对校企合作缺乏整体推进， 没有从系统的观点通盘考虑，统筹运作，使企业运行与办学诸要素之间有机结合、相互作用，构芤晟踔肿成一个具有特定功能的整体，最优化地实现办学目标，以期达到预期的效果。不少学校开展校企合作仍停留在聘请企业专家上课，举办企业家报告会，送学生去企业参观实习等浅层次合作，校企双方还是两张皮，离互动介入， 相互交融，深度合作，形成学校与企业的利益共同体还有较大差距。学校运作机制和企业运作机制、校园文化与企业文化存在较大差异，还没有真正融合。制约了校企之间的深度合作以及受教育者从学员、职业人到社会人的角色转化。
4、 校企合作发展不够平衡主要表现为中心城市的学校好于地市州的学校，工科类学校好于文科类学校，工程类专业好于管理类专业，另外，校企合作的地方特色、专业特色也体现不够等。