1、根据2015年一项统合分析研究，青少年出现功能性腹痛的盛行率可能达15~20%。
2、胃酸、乳糖不耐症 女性经痛需注意青春期之后的慢性腹痛成因，约略与成人相近。常见的器质性病因有：
3、胃酸相关疾病，包括胃食道逆流症、慢性胃炎、消化性溃疡、幽门杆菌感染等。2.乳糖不耐受，食用乳制品后出现腹痛、胀气、大量水泻且有泡沫或酸臭味。 3.腹壁肌肉性疼痛，特定的姿势或是动作合并腹痛，检查时可能有肌肉压痛。
4、泌尿道感染，可能合并发烧或是尿路症状，通常为腰痛或下腹痛。 5.青少女须注意是否为经痛、子宫内膜异位症、骨盆腔发炎、处女膜闭锁等问题。6.发炎性肠道疾病，特别是克隆氏症，患者常合并肛门周围廔管、体重异常减轻或生长迟滞、慢性腹泻或血便，必须提高警觉。
5、消化不良、大肠激躁症 腹型偏头痛适当排除器质性病因，且初步检验检查均属正常，则可能是功能性腹痛。青少年的功能性胃肠道疾患，其临床分类可参考发表于2016年的第四版罗马准则(Rome IV Criteria)。其中功能性腹痛定义为持续二个月以上的慢性腹痛，进一步可分成：
6、功能性消化不良：必须排除食道、胃及十二指肠的溃疡、发炎与幽门杆菌感染，给予制酸药物同样会改善临床症状。2.大肠激躁症：定义为一个月至少腹痛四天以上，并合并有以下三样特征至少一种，疼痛跟解便相关(常见为解便后疼痛改善)、排便频率改变、排便性状改变，合并便秘表现时慢性腹痛不因便秘解除而缓解。
7、腹型偏头痛：定义为发作六个月以上的阵发性腹痛，必须符合下列所有特征且至少发病两次，间歇性发生急性剧烈腹痛并持续一小时以上、间隔数周至数个月发作一次、疼痛无法忍受且影响日常活动、个别病人定型的发作型态与症状、合并有食欲不振、恶心、呕吐、头痛、畏光、苍白等典型症状两种以上、且排除其他器质性疾病。
8、腹痛也可能是身心引起 照会身心科由于腹痛也是身心症常见表现的身体症状之一，因此，医师与家长老师们仍应注意身心症共病的鉴别诊断，特别是诈病及代理型孟乔森症候群。如果患者出现反复与身体检查不一致的腹痛或其他身体症状、且长期逃避上学，除了安排相关检查之外，可能还要照会儿童身心科医师、社工师，进行适当的关怀与后续转介治疗。
