1、使用“基因注射器”道具对驾驶员进行升级。升级可以增加驾驶员攻击，生命，防御三种属性。但是驾驶员的等级不能超过指挥官的等级。
2、消耗“智慧之果”和金币可以对驾驶员进行进阶。进阶会大量提升驾驶员的攻击，生命，防御三种属性，同时开启驾驶员的潜能属性。每个驾驶员的潜能不同，有攻击潜能注重攻击，暴击率的提升;有防御潜能注重生命，防御，闪避率的提升。
3、进阶时需要驾驶员满足相应的等级，需要注意的是紫色驾驶员只可进阶8次，而橙色驾驶员可进阶10次增加10次潜能，同时进阶时获得的属性加成也更大。
4、驾驶舱是驾驶员的特色培养系统。可通过“强化晶体”道具强化驾驶舱。每位驾驶员的驾驶舱分为神经元连接器，头部借口装置，探查针，脊髓传导系统，双向通信回路，制动信号栓六种装置。
5、与原作同样，驾驶员与EVA之间具有同步率这一属性，消耗“神经元激发素”可以提高驾驶员与EVA之间的同步率，百分比增加驾驶员的生命，攻击，防御。在达到同步率50%和同步率80%的条件时分别会获得强大的攻击或者防御属性。
