1、检修麻烦 由于内置泵的水泵在集水箱内，一旦设备故障，就必须打开箱体进行检修，这时不仅会有异味散发，而且，电机浸没在水里，检修时手必须伸入污水中将水泵取出，才能检修，非常的不方便和不卫生。而且检修人员非常难找。
2、气密性差 内置泵的安装检修都会涉及到打开水箱箱盖，这样会导致异味散发，蚊虫、细菌的滋生长期如此不仅会污染坏境，还会影响家庭生活环境，检修维护后再次安装，污水箱不能达到首次安装使用的密封性。
3、安全性不高 内置泵的电机、控制装备都是安装在污水箱内部的，污水箱内一旦水位过高，污水就会透过通气孔漫进控制箱，就会导致水泵短路，甚至烧坏。