1、负责方面不同
教务处（有的学校也称为教务部，如北大）是学校等教育机构的教学管理机构，主管各教师的教课任务、目番舸榆毛标、进度及计划，学生的学习要求、目标、计划及考试等教与学各方面的事务，是学校的主要机构之一。
政教处是推进学校学生德育目标的职能机构，在书记的领导下带领班主任完成学校的各项德育工作任务。它制定学生爱国教育的工作计划等。
2、负责人不同
教务处的负责人为教务处长（或教务长，也有的叫教导主任）。政教处的负责人是校里的书记。
3、职责不同
教务处参与制定学院教学发展规划，组织专业建设规划的制订与实施。政教处制定班主任工作职责，领导各年级班主任。组织班主任学习，加强班主任师德建设，提高班主任工作水平，检查和评价班主任工作。
参考资料来源：百度百科-政教处
参考资料来源：百度百科-教务处