1、提高饲料的转化率和适口性经过em菌发酵或者是处理过的饲料，其中的大分子有机物会被分解为小分子的有机物，这样更有利于动物的消化吸收和利用，再加上其本身以及合成的各种活性酶等有机物营养素，可以大大的提高饲料的营养价值。
2、预防各种常见疾病Em菌益生菌能够提高牲畜和禽类的免疫力和抗病性，降低养殖动物的发病率，在养殖临床上有着预防和治疗的一体化效果，极大的降低了养殖中的药物成本支出。
3、提高经济效益由于em菌中的微生物本身的生命活动及其代谢物质的产生，丰富了饲料中的营养，增强了动物的生长能力，使得养殖的动物增重快、产奶高、产蛋多、缩短了饲养的时间、增加了日增重量，可以使得料肉比、料蛋比下降10~20个百分点。
4、提高繁殖率在牛、羊、猪等动物交配前20天开始喂养EM菌益生菌，母猪的产子率可以提高30~50个百分点，母羊的受胎率则可以提高到百分百，母羊的双胞胎和三胞胎逐渐增多；牲畜产出的小牲畜身体健壮，生长速度快；蛋鸡也可以提前10天左右产蛋，并且能够延长产蛋高峰期在两个月以上，产蛋率可以提高到15个百分点以上。
5、除臭祛蚊蝇，改善环境由于em菌益生菌有着对饲料转化的功能，特别是对饲料中氨的转化，从而降低了动物排泄物的恶臭气味，对于臭味、异味有点明显的消除作用，同时还能够大量的减少蚊蝇，养殖环境得到大大地改善，降低由蚊蝇传播的疾病和寄生虫发病率。
6、改善蓄禽产品的品质经有关部门检测，喂养em菌益生菌的畜禽产品可以大幅度的改善产品的品质，降低畜禽产品的药物残留和其他有害物质，例如鸡蛋中的蛋白质可以提高5.5个百分点，胆固醇和脂肪的含量可以下降73.6和82.2个百分点而且鸡蛋的蛋白粘稠，这极大的改善了鸡蛋的品质，同时有害物含量几乎没有。
