1、步骤一：查看项目配置，右击项目--->Properties--->Myeclipse----->web可以看到提示说 Web-root folder不正确。如下图所示但是点击 Browser直接修改Web-root folder，修改后点击保存，再次查看该属性时，属性还是以前的值，说明此种方式修改无效。由错误提示Web-root folder should contains WEB-INF sub directory可知，该目录其实就是webroot目录。接下来就是修改webroot编译后的文件存放的位置，使之和web-root folder对应。
2、步骤二右击项目---> Properties--->Java Build Path --->选中项目的src文件夹---->单击add folder出现如下图，找到webapp(因为web-inf文件夹在此目录项)，单击ok
3、步骤三：选择项目编译后，webbpp的输出目录，选择output folder:xxx点击右侧的Edit,出现如下图所示，找到步骤一中对应的路径
4、此时在查看web-root folder时，错误提示消失，再将项目部署到tomcat中，tomcat已经可以正常编译了。