除了基本净化量和工作被罂溶廴噪声外，作为空气净化器最主要组成部分的空气过滤器，也是在购买前一定要注意挑选的。因为室内空气中的污染物主要有细菌、病毒、灰尘、花粉、霉菌孢子、臭气和有害化学忻稿痞烁气体等，而常见的几种空气过滤器技术，在针对不同污染情况时，效果也是各有不同。
目前空气过滤器中最普遍被使用的技术是通过HEPA(高效空气微粒滤网) 进行物理过滤，HEPA通常由化学纤维或玻璃纤维材质组成，常见的HEPA滤网由多层折叠的纤维膜构成，展开后的面积相当于折叠时的数十倍。
HEPA对直径为0.3微米(PM0.3)以上的微粒滤除效率高达99.97%以上，是烟雾、尘埃微粒以及细菌等污染物最有效的过滤媒介。且HEPA发展相对成熟，是国际上公认最好的高效过滤材料，所以其被空气净化器主流品牌普遍采用。但HEPA对有害化学气体则无能为力，同时其在使用期间也需要定期更换、维护。
相对于HEPA技术滤网对苯、甲醛等有害化学气体滤除效果欠佳的情况，大部分品牌的空气净化器还采用了基于活性炭技术的滤网，活性炭滤网通常采用格状结构，格子内装有活性炭颗粒，特殊的构造加上活性炭的特性，使得此种滤网具有风阻系数小、比表面积大、吸附能力强等优点。Hoover空气净化器为例，它的DualMax Pro系列采用Truman Cell专利过滤技术，能过滤空气中低至0.01微米的污染物，并有效捕捉、阻隔宠物毛发及皮屑、香烟烟雾、花粉、微尘及其他致敏源。同时Dual MaxPro还配置了Helio神盾过滤网，减少家居中所产生的化学气味，例如油漆、气溶胶、清洁用品及新地毯和家具散发的异味。TrumanCell过滤网可重复使用，无需更换。
活性炭是以煤、木材和果壳等原料，经炭化、活化和后处理而得。由于炭粒的表面积很大，所以能充分接触、吸附有害化学气体。但活性炭只能暂时吸附一定数量的污染物，当温度、风速等升高到一定程度时，其所吸附的污染物就有可能游离出来造成二次污染。所以使用期间也要定期更换，避免其吸附饱和。