1、申请：在药品监督管理局一楼行政受理窗口进行申请
2、受理审核和结果：能当场受理或通过当场补正达到受理条件的，直接进入受理步骤，受理后网上直接显示受理编号 根据一次性告知通知书内容进行补正后达到受理条件的，补正完成后受理；收件之日起5个工作日内未收到一次性告知通知书的，收件之日起即为受理。
3、审查结果：对经审查不符合申报要求的，退回受理环节，并说明原因；对符合申报要求的，提出审核意见，转决定环节。
4、作出决定： 1、作出准予行政许可或不予行政许可的决定。 2、行政征收、行政给付、行政确认、行政奖励、行政裁决、其他行政权力：作出准予办理或不予办理的决定。决定内容：1、申请内容是否符合法定权限；2、申请人主体是否合法有效；3、申请人所申请许可内容是否符合申请条件；4、申请人所提交的申请材料是否符合法规须提交的全部材料；5、审查程序是否符合相关法律法规的规定。
5、审批通过后，申请人在云南省药品监督管理局网站“网上办事”窗口自行下载电子版《药品经营许可证》。
6、在云南省药品监督管理局门户网站公开。