1、首先打开flowjo，页面显示；保存在电脑里的fcs文件
2、手动打开添加sample，或者直接将fcs文件拖拽
3、拖拽完成后，双击Ctrl组的sample，弹出散点图对话框。
4、选取合适的形状圈出要分析的细胞，小编喜欢不规则图形这个，比较好操控。圈出细胞后，外圈为细胞碎片，可以不分析。
5、双击圈出的位置，弹出的就是圈出的细胞，舍弃了外圈的细胞碎片。这时候开始分析，选取合适的横坐标，例如小编本次分析表柔比星为红光，选取PE。纵坐标选Histogram，直方图的意思。修改完横纵坐标后，原来的散点图就变成了直方图。
6、如果是只分析一个样的话，到这步就可以copy图片啦；如果要分析多个样，那是不是要把每个样都像上述的过程来一遍呢！答案是不用的。这坎睾牢慨便是flowjo的强大之处，一个样分析好了，就可以直接按照相同的设置处理其它样哦。如下图，鼠标拖拽到all samples，然后其他所有样点开都已经按照Ctrl组的画法圈好了散点，双击圈住的位置就直接得到直方图啦，横纵坐标都不用再调啦。
7、那么怎么把直方图都组合重叠在一张图里呢？嚼但匙噻首先将图都copy到layout工作台。然后鼠标拖动其中一张图轻轻放到薷蒴塾寒另一张图上，重叠，就可以直接组合了哦！组合完可以看到每个峰代表哪个样，并且可以自主调节颜色。
8、双击组合图，弹出的框里可以更改到model模式，可以使两个峰高度大致相同（只是为了图更好看点，对数值没有任何更改）。这个对话框还可以更改线的颜色；把legend√取消掉可以将图三的框去掉哦~
9、如果单纯想要曲线图，可以将填充的颜色去掉，就变成这样啦。好啦，这就是flowjo直方图的基础过程，下期将降解散点图的做法哦
