1、故事背景 承接前作历史 以三国后期作为舞台：《幻想三国志5》的时空背景，发生在比前四代都更为靠后的三国时代后期
2、在五代的故事中，曹操、刘备都已经驾崩，玩家所熟知的魏蜀吴三名国君仅余孙权在位。
3、不过此时北方曹丕已经登基，以司马懿为左右手积极扩张势力;西南刘禅也已在诸葛亮的辅佐下即位。
4、在这样的三国新气象中，本代游戏的主角，已经悄悄现身在蜀汉西南边陲的一座小村庄里…
5、神话乱战 北冥海神遁逃人间：上损枉颜陛古之时，北方天帝颛顼身边曾有玄京、玄冥两位海神共同辅佐，然而玄京却不知为何铸下大错，被天界派人封印于极北之地，此后世间只知玄冥之名，而玄京却连存在却不复被人记忆。
6、然而仅仅数年前，黎王紫丞在世间引起一场仙魔大战，影响遍及三界，遭到封印已久的玄京也趁隙从封印中脱出，遁逃人间…
