1、孕妇结石 该类患者一般来说是不宜进行碎石的，特别是下段输尿管结石更是不宜行ESWL治疗，以避免冲击波及射线对胎儿产生不良影响，可在分娩后再行碎石。对于疼痛难以忍受的中上段输尿管结石则可在严密控制下进行ESWL治疗，国内外就有许多报道了对孕妇进行ESWL治疗的研究报告，还未发现ESWL治疗对婴儿的影响。
2、合并有糖尿病的患者，如病情未控制，也不适宜碎石，以免碎石后可能发生无法控制的感染。
3、感染严重或急性感染者，碎石前应慎重考虑。ESWL可能加重感染的程度，引发菌血症、毒血症等严重症候。
4、高危病人及单个、多个器官功能不好的患者，如心力衰竭、肾功能不全、独肾等患者，在紧急情况下可在当时医疗条件控制能下进行EWSL治疗，万一出现变症，要能及时处理。
5、肥胖的患者则可能因为定位困难不能进行碎石。
6、肾结石一般不行体外碎石治疗，原因是即使碎石成功，也不能保证结石都排出肾脏。
