1、由于在中国的不同地区之间人口和耕地资源的分布极不均衡，各地耕地占用税平均税额有些地区人烟稠密，耕地资源相对匮乏；而有些地区则人烟稀少，耕地资源比较丰富。各地区之间的经济发展水平也有很大差异。考虑到不同地区之间客观条件的差别以及与此相关的税收调节力度和纳税人负担能力方面的差别，耕地占用税在税率设计上采用了地区差别定额税率。
2、税率规定如下：1、人均耕地不超过1亩的地区（以县级行政区域为单位，下同），每平方米为10～50元；2、人均耕地超过1亩但不超过2亩的地区，每平方米为8～40元；3、人均耕地超过2亩但不超过3亩的地区，每平方米6～30元；4、人均耕地超过3亩以上的地区，每平方米5～25元。
3、耕地占用税以纳税人实际占用的耕地面积为计税依据，以每平方米土地为计税单位，按适用的定额税率计税。其计算公式为：应纳税额=实际占用耕地面积（平方米）×适用定额税率