1、泡水鉴别：黑果枸杞的颜色很浓，并且含有大量的青花素，在不同水质下会呈现不同的表现。泡酸性水（矿物质水）成紫色，泡碱性水（山泉水、自来水等）成蓝色。
2、性状鉴别：黑果枸杞果实干皱，湿浸后浆果卵圆形，略扁，长5～8mm。直径3～5mm。表面紫黑色，具不规则账修赔佐皱纹，略有光泽。果实残留花柱和果柄痕以及宿存的花萼。质地柔软滋润。种子一粒，长卵形，长3.5～5mm，宽2～3mm，红棕色或棕褐色，顶端略尖，圆三棱状，具6条浅纵向凹沟，延伸至中部，基部钝圆，具十数个类圆形陷窝。气微，味甜微酸。成品黑枸杞在干了以后，果柄朝上可以立起来，并且摘掉果柄后的部位是一个很圆、很白的圈，干透后用手一捏的话就成了粉末，这是其它假冒果实所不具备的一些特性。
3、显微鉴别（果皮横切面）：果枸杞的外果皮为一列扁平细胞，壁较厚，外被角质层，外缘呈微波状突起。中果皮为十数列薄壁细胞，细胞中含有草酸钙方晶。双韧型维管束散列。内果皮细胞1列，较小，呈切向延长。
4、粉末鉴别：黑果枸杞粉鹤瞩阚勒末黄褐色。外果皮碎片众多，表面观细胞呈多角形或类长方形，壁厚，内含黄棕色颗粒物，可见不定式气孔，副卫峙僮侯劝细胞5～7个和单细胞非腺毛。种皮表面细胞多角形、类方形，无色或淡黄色，常与薄壁栅状细胞相连，隐见角质纹理及细小颗粒物，壁薄，非木化；种皮栅状细胞成片，淡黄色，有两种：厚壁型侧面观狭长，稍不平整，末端尖、钝圆或分叉，长120～250μm，宽7～19μm。壁极厚并强木化，胞腔不明显或细沟状;顶面观壁极厚，胞腔小，孔沟不明显。薄壁型侧面观梭形、长方形，壁较厚，胞腔大，孔沟明显；顶面观呈类多角形，孔沟细密，胞腔较小，含草酸钙晶体和色素块。果皮非腺毛易察，无色或淡黄色，单细胞，较平直或稍弯，先端渐尖，长75～113μm，直径12～16μm，，壁薄，微波状弯曲，非木化或微木化，表面具细小的疣突。草酸钙方晶较多，方形、长方形、菱形，直径6～25μm。色素块较多，方形或不规则形，黄棕色或橙红色，直径15～19μm。胚乳细胞多角形或类圆多角形，含脂肪油滴，并充满糊粉粒，有的可见拟晶体，圆多角形、菱形。
