癌症的治疗和预后和癌症在哪一期密切相关。直肠癌的分期基于原发肿瘤的侵润深度（用T来代表），是否有淋巴结转移（用N来代表）和远处转移（用M来代表）。
原发肿瘤：T
Tx： 原发肿瘤无法评价
T0： 没有原发肿瘤的证据
Tis： 原位癌：局限于基底膜（上皮内）或固有层（粘膜内）内而无粘膜肌层扩散
T1： 侵肌粘膜下层
T2： 侵及肌层
T3： 侵及浆膜下层，或无浆膜覆盖的结肠周围，直肠周围组织。
T4： 侵及其它器官或组织，和/或穿透脏层腹膜。通过浆膜表面直接扩散被认为是T4。在直肠周围或结肠周围脂肪内直径>3mm肿瘤结节，直肠癌分期没有在它范围内的其余淋巴结的组织学证据，应被作为直肠周围或结肠周围的区域淋巴结转移来分类。然而，一个直径≤3mm的肿瘤结节被作为不连续扩散归类到T3
区域淋巴结：N
Nx： 淋巴结状况无法评价
N0： 无区域淋巴结转移
N1： 1~3个阳性淋巴结。在结肠周围或直肠周围脂肪内或在邻近肠系膜（结肠系膜脂肪）内没有其余淋巴结组织的证据的转移结节或病灶等同于区域淋巴结转移。在结肠周围脂肪内仅能通过显微镜看到的多个转移灶应该认为是单个淋巴结转移。在结肠周围或直肠周围脂肪内的直径>3mm肿瘤结节而没有在它范围内其余淋巴结的组织学证据，应被作为直肠周围或结肠周围的区域淋巴结转移来分类
N2： 4个或更多阳性淋巴结
远处转移：M
Mx： 远处转移无法评价
M0： 无远处转移
M1： 有远处转移。髂外或常见髂总淋巴结的转移被认为是M1
其它直肠癌分期：
0期：Tis N0 M0
I期： T1~2 N0 M0
II期： T3~4 N0 M0
III期： 任何T N1~2 M0
IV期： 任何T 任何N M1
首次诊断的分期：
I期： 39.2%
II/III期： 39.9%
IV期： 20.9%