1、能耗方面：从脱盐的直接能耗来说，反渗透海水淡化法明显优于单目的的蒸馏海水淡化法，但不明显优于(热电造水)的蒸馏海水淡化法。而且由于反渗透膜的寿命短，换膜费用高，膜本身就反映了能耗。对蒸馏法来说，过程的直接能耗，不同地区差别很大，需要进行技术经济比较确定。
2、海水淡化的制水总成本方面：由于膜的寿命和膜装置的限制，使得膜法在大规模处理海水中仍处于不利地位。因为反筻芗氍焕渗透法的制水成本，受膜寿命和装置规模的不利影响超过了低能耗所带来的好处，一般认为海水淡化装置容量超过日产6000t淡水时，双目的蒸馏法比反渗透法更经济。
3、海水的预处理方面：进入蒸馏装置的海水无需进行预处理，仅设置海水过滤网即可。而进入海水反渗透装置的海水需进行絮凝澄清、过滤和加氯等预处理。并且由于反渗透的水利用率低，所以预处理系统庞大，投资也较高，占地面积也大。
4、其他配套设施方面：对于新建电厂，蒸馏法需要启动蒸汽，因此启动锅炉的容量应该考虑满足淡化设施的需要，启动锅炉的补充水应考虑一套单独的水处理设施用于启动。