1、天然玛瑙区别于假玛瑙的最显著的标志，是其横断面有同心层纹结构，利用这个标志，整块玛瑙较为容易识别，而经切割后的制成品，由于没有整齐明显的图案，则容易认错。
2、真玛瑙色泽鲜明光亮，假玛瑙的色和光均差一些，二者对比较为明显。天然玛瑙颜色分明，条带花纹十分明显，而仿制的假玛瑙多数颜色艳丽、均一，给人一种假的感觉。
3、真玛瑙透明度不如人工合成的好，稍有混沌，有的可看见自然水线或“云彩”，而人工合成的玛瑙透明度好，象玻璃球一样透明。
4、假玛瑙多为石料仿制，较真玛瑙质地软，用玉在假玛瑙上可划出痕迹，而真品则划不出。从表面上看，真玛瑙少有瑕疵，劣质则较多。
5、真玛瑙冬暖夏凉，而人工合成玛瑙随外界温度而变化，天热它也变热，天凉它也变凉。
6、真玛瑙首饰比人工合成的玛瑙首饰重一些。