1、产地不同大黄花鱼和小黄花鱼虽然都产自我国沿海地区，但是一个偏南一个偏北。小黄花鱼一般主要分布在渤海和黄海领域。而大黄花鱼则主要分布在东海、日本海以及南海等海域，渤海是见不到大黄花鱼的。
2、外形不同大黄花鱼和小黄花鱼除了一个大一个小，外形也是有很大区别的。比如大黄花鱼眼睛大、脑袋大、尾巴根部比较细，鱼鳞也非常细小。而小黄花鱼脑袋小、眼睛也小，而尾巴根部相对比较粗。
3、口感不同对于做菜来说，最有影响的当然就是口感了，而大黄花鱼和小黄花鱼的口感也是有很大区别的。大黄花鱼因为体型比较大，所以肉比较多，但是肉质不如小黄花鱼细嫩。小黄花鱼肉少，肉质细嫩，但是鱼刺会比较多。
4、烹饪方法不同由于大黄花鱼和小黄花鱼的口感不同，因此它们适合的烹饪方式也是不同的。大黄花鱼更适合焖炖或者红烧；而小黄花鱼更适合煎炸，把刺煎炸的酥酥的，更加美味。
5、营养成分不同大黄花鱼和小黄花鱼都是非常有营养的，但是相对来说，小黄花鱼比大黄花鱼多了一些微量元素，比如钙、铁等，要比大黄花鱼营养更加丰富一些。
