1、浮游生物：海洋浮游生物是一类海洋生物，它们缺乏发达的运动器官，没有或仅有很弱的游泳能力，它们悬浮在水层中并经常随洋流运动。其中，通过光合作用将海水中的无机化合物转化为生物代谢所需的有机化合物的称为浮游植物，它们没有这种能力。必须将浮游植物用作诱饵者才称为浮游动物。据初步统计，全世界各种大洋中有 180多种可形成赤潮的浮游生物，其中 63 种在中国的浮游生物中被列出。
2、人类活动：大量工农业或养猪业工厂排放大量猪粪废水和生活污水排入海，特别是未经处理直接排入而导致近海、港湾富营养化程度日趋严重；由于沿海地区发展迅速，海洋水产养殖业扩大，也给海洋环境和水产养殖业自身带来了污染问题；海水养殖的自我污染也是引起赤潮的因素之一；全球海运业的发展导致国外有害赤潮物种的引入。
3、全球气候的变化也导致了赤潮经常发生。