1、先找病原 棉苗立枯病由立枯丝核菌引起，主要营寄生生活，但在土壤中有很强的腐生生活能力。菌丝可在土中自由扩展，并随水扩散。当外界条件不利于菌丝生长时，菌丝体可形成菌核，菌核细胞可萌发多次，繁殖迅速。菌核的存活期长，在土壤中可存活几个月至几年。
2、 采用各种农业措施，造成有利于棉苗生长发育的环境条件，培育壮苗，提高棉苗抗病性。倒茬轮作可减少土壤中的病原菌，降低苗期发病率。
3、 育苗移栽的苗床土要每年更换，最好用种植禾谷类作物田的土壤，并施入充分腐熟的农家肥，保证棉苗在苗床内茁壮生长。
4、 秋季进行深耕，将棉田带菌残枝落叶翻入土壤下层，耕地前施足底肥；实行冬灌保墒，进行春灌的不要临播前才浇水，以免降低地温；冬灌比春灌病情指数可减少10-17；地势低洼棉田要有排水措施；播前要将地整平整细；易发病地在5厘米地温稳定在15度以上再播种。
5、加强苗期管理，出苗显行后即开始中耕，雨后及时中耕，以降低土壤湿度，提高地温,以得到更高的收获。
