1、按规定缴纳社会保险费：企业应当按照国家相关规定缴纳员工的社会保险费，包括医疗保险、工伤保险、失业保险和养老保险等。员工病假期间，企业需要继续为员工缴纳社会保险费，不得停缴或减少。
2、按照劳动合同约定计算病假工资：企业应当按照劳动合同的约定，根据员工的工资、职务等因素计算员工的病假工资。一般来说，员工的病假工资应当不低于当地最低工资标准。
3、根据病假时间计算扣除金额：企业可以根据员工的病假时间，按照劳动合同的约定计算病假工资，并在发放工资时扣除员工病假期间的工资。一般来说，企业可以根据员工的实际病假时间扣除工资，而不是一律扣除。
4、注意不得违反法律法规和政策规定：企业在扣除员工病假工资时，需要遵守国家相关法律法规和政策规定。例如，根据《劳动法》规定，企业不得违反劳动合同、集体合同和规章制度等约定，扣除员工的工资。