1、天然水晶的生长环境，多是在地底下、岩洞中。由于在地底、岩洞中的生长空间多狭窄，尤其在遇到地震时，或地壳变动时，甚至容易遭到其他矿石的挤压，常常会压迫产生不同的「晶面」。
2、对于通透形的水晶来说的，就是其内部视觉上象是有裂痕，有花花的感觉比如粉晶、绿幽灵、紫水晶、白水晶球、柱等都很常见。本来是应该通透的但看上去却不通透，有雾蒙蒙的感觉或是感觉里面象有棉絮状物质一样 。
3、天然水晶中一般都有一些气泡，一般都是棉絮的，如果是质量优良的合成水晶制品，那么其内含气泡越密实，工艺越高。
4、天然水晶表面感觉像坑洼的地方，是水晶在成长过程中自然形成的而并非是人为造成的损伤。绿幽灵、钛晶、金发晶上都比较常见。
5、天然水晶是天然形成，其色泽并不均匀，同一物体也会出现色差，期间还可能有细小的杂质或丝绵般的痕迹；而人造水晶或玻璃制品色泽一致，纯度高。
6、天然水晶硬度比人造水晶和玻璃要高，两者互划，也会发现问题。
7、天然水晶晶莹、润泽，表面似乎有一层薄薄的油色，白水晶白的发青；而人造水晶看上去则干而发白。
8、天然水晶凉度高，有油腻感；而人造水晶则没有这种感觉。
9、天然水晶竖放在太阳光下，无论从哪个角度看它，都能放出美丽的光彩；
10、将水晶放在一根头发丝上，人眼透过水晶能看到头发丝双影的，则为天然水晶，主要是因为水晶具有双折射。